Здравствуйте, Румия! Наличие второй трудовой книжки не является противозаконным. Нарушением будет являться только трудоустройство одновременно по каждой из них. Информация о том, что у Вас имеется еще одна трудовая книжка, так или иначе, известна налоговым органам. Для Вашего личного спокойствия Вы можете сообщить бухгалтерии о том, что нашли утерянную ранее трудовую книжку и сообщить, что не занимались ее восстановлением по некоторым причинам. Однако это не является обязательным и какого-либо наказания за обладание двумя трудовыми книжками не предусмотрено.
В будущем я настоятельно рекомендую Вам пользоваться только одной трудовой книжкой, ведь при оформлении пенсии можно предоставить только один документ. Именно по нему будет производиться расчет пенсии.